现代企业大多建立了自身的ISO 9000质量管理体系，但在实施ERP系统时，大部分企业未能将其一体化结合考虑，致使两者之间信息流通不畅，数据不能有效利用，造成了大量重复劳动和重复投入资源的浪费，直接影响了工作效率和组织绩效的提高。
那么，究竟如何实现ERP与ISO 9000系列的有效集成和应用，以提高企业的运作效率呢？
ERP和ISO有一致的管理思想
从管理思想来看，ISO 9000系列的“过程方法”所采用的PDCA循环管理机制与ERP体现的事先计划、事中控制的思想是一致的，贯穿着对产品及其生产过程、设备、工具、人力资源、管理职责、财务资源、信息沟通等各个方面的管理活动。
ISO 9000系列体现的“管理的系统方法”与ERP对资源整合的理念也有着相似的内涵，“管理的系统方法”内涵是将相互关联的过程作为系统加以识别、理解和管理，有助于提高组织质量管理体系的有效性和效率。
而ERP通过实行业务流程重组和供应链上物流、资金流和信息流的整合达到提高效益和竞争力的目的。
ERP要配合ISO的要求
按ISO的管理思想，组织内所有与质量有关的直接和间接活动都要受控，如果将实施ERP的活动当作一个过程来考虑，则过程方法即所谓PDCA循环也适合于ERP，而其中对ERP的控制准则就是ISO的相应要求，ERP的改进方向就是实现和超越组织的当前目标。
如果ERP的设计完全独立于ISO的相关原则，那么很可能有些ISO标准要求的、本可以通过ERP系统来完成的活动没有被考虑进去，则所实现的管理功能相对于ISO标准来说是不完善的。
在这种情况下，企业若要使其质量管理体系符合ISO标准，就要以人工的方式做一些额外的工作以补充ERP的不足，这样一来，就大大增加了系统开销，降低了运作效率。因此，在ERP实施的初期，对业务流程重组和二次开发的策划应充分考虑ISO标准的要求。
ERP与ISO的区别
首先，管理关注的颗粒度不同。ISO体系是运用PDCA过程管理思想从质量管理角度看企业运作业务链上面各个业务处理过程，关注每个业务关键点是可追溯、可控制的，为此规定了一些标准与原则。
ERP更关注业务处理过程中业务集成、数据收集、数据处理等业务中资金、物流等单据处理过程，ERP关注的更为细节。
其次，ERP和ISO中流程的差异。了解这方面的差异，首先需要了解流程管理在企业之中分为多个级别，例如我们常说的价值链，实际上就是企业的一级流程。
ISO和ERP由于其关注的管理颗粒度不同，因此，ISO大都描述的是2级或3级流程，而ERP则是4级或者5级的流程。
第三，ERP和ISO中流程强调点不同。BPR更强调“重组”和“再造”， ISO强调“识别”和“确定”。前者是按项目管理方法进行的突破性改进，由日常运作之外的跨职能的小组来实施，如：ERP实施顾问小组。
由于这种改进的彻底性和全面性，所以改进完成之后有一个相对的稳定期。
ISO则是由组织内人员对现有过程进行渐进的持续改进活动，相对稳定的周期比较短，所以要求在识别和确定过程的顺序和相互作用时，要考虑形成必要的体系文件和记录。并确定过程的测量和监视方法，以把握改进的机会。
虽然ERP和ISO具有一定差异性，但是根本上两者是统一的，都是为实现业务处理的增值而形成的。
同时由于，两者在管理颗粒度、流程级别和强调点上面差异并非根本的不合拍。更有价值的，ERP是支撑ISO的有效工具，ISO同时为ERP提供了原则和管理体系框架。
如何考虑二者的结合
在考虑ISO与ERP的结合时，识别在何种程度上采用“业务流程重组”或“过程方法”是必要的。
一般来说，对于ERP中产生静态数据（基础数据）的过程（或流程），如:生产计划和控制过程，应该采用业务流程重组的方法以确保数据的准确性和可靠性。
另外，对于受人为因素影响较少、程序化程度高、主要由计算机来完成的活动，如文件管理，也可以采用这种方法。
但对于一些难以程序化、主要由人来完成的活动，如内部审核，应采用过程方法来控制。
对于一些部分由计算机执行、部分由人来完成，且呈规律性变化的流程，在经过业务流程重组区分出由人和计算机执行的任务后，通过在ERP系统中建立可用户化的动态模型是适宜的。
慎重进行ERP选型
ERP系统选型要遵守“知己知彼原则”，所谓“知己”就是在理解ERP系统的基础上，通过企业管理诊断和需求分析，明白企业的管理需求。结合ISO标准，通过投资效益分析明白投资的效果和选购系统的恰当价位。
所谓“知彼”，就是明白软件商和咨询顾问公司的特长，能不能满足企业的管理需求。
先知己，再知彼。这个选型流程很像就医的过程，先要有一些医学常识，通过检测能够判断和确诊自己的病情，然后对症下药，而且要遵循药品的用法，发挥最大的药效。
遵循这个原则，即使不是百战百胜，也会极大幅度减少决策失误，为信息化成功创立良好基础。
如果ERP的设计完全独立于ISO的相关原则，那么很可能有些ISO标准要求的、本可以通过ERP系统来完成的活动没有被考虑进去，则所实现的管理功能相对于ISO标准来说是不完善的。
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